Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3KNL4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3KNL4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms