Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb33Q30KN3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms