Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp8Q2V6D6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbp8Q2V6D6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms