Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms