Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4cQ2MDG1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms