Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rhox4fQ2MDF8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rhox4fQ2MDF8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4fQ2MDF8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Rhox4fQ2MDF8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Rhox4fQ2MDF8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4fQ2MDF8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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