Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo4Q149C3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lingo4Q149C3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms