Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne7Q0VE82 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms