Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab42Q0PD08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms