Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc45a4Q0P5V9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc45a4Q0P5V9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms