Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrioQ0KL02 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms