Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata4Q08369 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata4Q08369 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata4Q08369 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata4Q08369 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata4Q08369 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata4Q08369 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata4Q08369 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gata4Q08369 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gata4Q08369 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms