Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms