Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
F13bQ07968 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms