Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah1bQ06985 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms