Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r236Q05A06 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms