Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fmn1Q05860 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fmn1Q05860 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms