Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk16Q04735 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk16Q04735 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms