Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr5Q04683 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms