Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx2Q03358 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms