Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs2Q03350 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms