Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RykQ01887 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RykQ01887 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RykQ01887 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RykQ01887 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RykQ01887 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RykQ01887 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RykQ01887 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RykQ01887 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RykQ01887 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms