Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd1Q01822 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms