Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme2Q01768 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms