Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HmgcrQ01237 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HmgcrQ01237 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms