Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col1a2Q01149 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms