Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms