Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms