Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms