Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cds1P98191 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cds1P98191 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cds1P98191 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cds1P98191 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cds1P98191 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cds1P98191 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cds1P98191 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms