Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms