Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms