Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama4P97927 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama4P97927 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms