Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc1P97496 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc1P97496 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms