Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms