Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Frg1P97376 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Frg1P97376 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms