Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpcaP84075 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpcaP84075 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpcaP84075 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms