Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx1P82976 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx1P82976 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms