Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gabpb2P81069 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb2P81069 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms