Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx3P81067 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms