Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct4P80315 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cct4P80315 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cct4P80315 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct4P80315 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms