Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf3P70671 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf3P70671 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf3P70671 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf3P70671 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf3P70671 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf3P70671 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irf3P70671 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irf3P70671 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irf3P70671 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms