Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms