Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chl1P70232 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chl1P70232 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms