Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabrb3P63080 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabrb3P63080 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabrb3P63080 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabrb3P63080 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabrb3P63080 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabrb3P63080 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms