Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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