Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3P62908 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms