Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps11P62281 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms