Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps29P62274 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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