Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrch1P62046 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrch1P62046 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms