Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga11P61622 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Itga11P61622 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga11P61622 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms